懲罰員工遲到而扣除工資，是許多公司采取的一種管理策略。然而，上海一位員工的工資在一年內被扣除了20多萬元，這種嚴厲的處罰是否合理呢？

江某在2019年9月17日開始在某醫療公司擔任內勤工作。公司規定員工必須進行考勤，否則將被視為曠工。每月遲到或早退10分鐘以上30分鐘以下，將被扣除當月工資的1%。每月遲到超過3次，第4次遲到將被視為曠工一天，每曠工一天將被扣除8%的工資。

在2020年11月30日至2021年11月30日期間，公司根據規定和江某的考勤記錄，從江某的工資中扣款總計20.9萬元。江某向勞動仲裁委員會提出申請，認為公司以多次曠工為由扣除工資無法律依據，并要求支付工資差額。仲裁委支持了江某的請求，公司不服并起訴至上海市黃浦區人民法院，要求不支付工資差額。

黃浦法院審理認為，用人單位可以規定遲到員工扣除工資，但行使管理權應合理和善意。明顯不合理的規章制度，不能作為處罰員工的依據。

在本案中，醫療公司沒有罰款權，如果為了懲罰而扣除過多工資，既違反法律規定，也違背常理。因此，按照日工資扣除相應缺勤時間的工資較為公平合理。

經核算，江某缺勤應被扣工資1.2萬元，但實際被扣了20.9萬元。因此，江某要求公司支付工資差額，應予支持。法院最終判決公司支付江某2020年11月30日至2021年11月30日期間的工資差額19.6萬元。

一審判決后，雙方均未提起上訴，本案現已生效。

關于遲到罰款的合法性，我國法律明確規定，對財產的處罰只能由法律、法規和規章設定，用人單位并不享有對勞動者罰款的權利。

因此，用人單位無權對勞動者實行經濟罰款，但可以通過規章制度將勞動者的無故遲到、請假等行為作為考核依據，達到“獎勤罰懶”的目的。用人單位的規章制度在符合法律法規的同時，還要兼具合理性，并遵循“工作量相適宜”原則，即用人單位扣除勞動者的工資額度應與勞動者“缺席”延誤所造成的損失相適宜，不得超過合理范圍。